第一篇以“看《风月宝鉴》概论”为题，从八个方面概括了阅读和研究《红楼梦》的方法。即(一)看反面；(二)释代字；(三)谐韵释义；(四)拆字谐韵；(五)解剖归并；(六)对偶求证；(七)名实相符；(八)巧接。何谓看反面?杜氏说：“《红楼梦》之反面，即是反常地方，反常的地方，就是问题所在，故看《风月宝鉴》，要看反面。”例如第四十九回史湘云和宝玉商议如何吃鹿肉，杜世杰便说这正是书中反常的地方，实际含义是：“史湘云应读史上云，鹿肉应读虏肉，那便是影射历史上的‘壮志饥餐胡虏肉’，以救后世攘夷也。”所谓“代字”，据说是指书中为隐藏真事而使用的代名词，如真谐韵为甄，代表汉族、朱明，假谐韵为贾，代表伪朝或金人；五行的火、土，色彩的赤、绛，也代表朱明、汉族，金、水及青、翠、绿则代表金人、满族、清朝。所以第十七回写大观园的水“从东北山凹里引到那村庄里”，就是影射金人由东北山凹被吴三桂引进北京。姓氏方面，金、赵、柳、薛指金人，林姓指朱明，夏、周、秦指汉人。花草则以菊花代表逸民及故明文化，海棠代表金人之后妃及其文化。谐韵释义是说“红学自始至终，皆是谐韵格，只有少数兼采拆字格，或会意格”，如秦既代表汉族，则秦邦业之子秦钟，就是“秦邦之业终结，其含义为明亡”，秦显便是汉族要复兴的意思。因此，贾环可谐韵读作贾府之患，周瑞也就是汉人之瑞，拆字谐韵，为的是补谐韵格之不足，如琴字可拆为今上二王，况朱明之二王；珍字可拆为今王，谐韵读金王，代表金人之王；潘拆字为三番，谐韵读三藩等等。解剖归并，是把《红楼梦》中各人事迹解剖出来，归并互相有关者，从而找出所影射的历史人物。如宝玉的母亲是王夫人，即帝王的夫人；父亲贾政，代表伪朝执政；薛宝钗为宝玉之妻，曾住蘅芜院，蘅芜为香名，香院便是椒房，所以香艳之君正是皇后；宝玉的小厮叫茗烟和焙茗，谐韵读为明阉背明，即明朝的太监后来又做了清宫之太监。杜世杰说，这些人物关系明显地表现出宝玉的帝王身份。对偶求证是说“红学中之人与事，是无独有偶”，如宝玉对黛玉，一个是包欲而生，一个带欲而死；秦业对贾政，前者指汉族的邦业，后者指伪朝之政；贾环对周瑞，即金人之患与汉人之瑞，等等。名实相符，杜氏解释为：“红学上之人物，其行为与品德，必与其名字谐韵之意义相吻合。依此原则，名恶者其人必恶，名善者其人必善，名白者必定白，名黑者必定黑，名行者必动，名止者必定。”如娇杏谐音侥幸，冯渊谐为逢冤，脂批亦持此说，可以说符合杜世杰的原则。但贾环虽可释为金人之患，也可以谐音读作假患，即不构成金人之患，这如何解释?第八种方法是巧接，杜世杰解释为“巧妙的接合或接替”，书中的巧姐就是“巧接”的意思，杜氏认为这是“读红学密法之一”。
　　由以上八法，《红楼梦原理》“各论”中，一旦涉及具体人物的索隐，一般都列一简表，分“角色”、“拆字”、“谐韵”、“世法”、“扮相”、“性别”等项，然后依次牵合明清之际的有关史实，与《红楼梦》中的情节加以比附。如贾瑞在书中的角色有两个，一是贾瑞，一是贾天祥；贾瑞谐韵假瑞，世法则为伪朝之瑞，扮相是耑情王，性别代表满；贾天祥谐韵假天祥，世法是假文天祥，扮相为洪承畴，性别代表汉。说贾瑞是假文天祥，因而影射洪承畴，王、沈及邓狂言都曾这样主张，但杜世杰将这种主张更加理论化了，并抽象出一种公式，则是他的独家发明。
　　“总论”第二篇论述《红楼梦》的结构，提出佛学是《红楼梦》的精神，诅咒金人、复兴汉族，即悲金悼玉是《红楼梦》的政治意识，生动的文字是《红楼梦》的仪表，三者“合而为一，离而为三，各有其本，各显其形”，所以在结构上是“三重组织”。此外，还提出阴阳互变、真假一体、名词与世法、名词之创造、名词之运用、双关叙事、加词复述等八个方面的特征，为自己进行索隐提供尽可能多的理论根据。把红学索隐理论化和系统化，是《红楼梦原理》的主要特点。所谓阴阳互变，杜世杰解释说：“红学上人物之创造，即本太极生两仪之原理，所以每一角色皆兼演阴阳二象。”真假也是如此，无非指同一人物既扮演真又扮演假。如王夫人，应解作国王的夫人，但其子宝玉况清朝之帝王，所以她是假方之母；宝琴是王夫人的义女，况朱明之二王，所以王夫人又是真方之母，一人具备真假两个面相。世法即世间法，如宝钗可以读作抱才，代表才智，黛玉读作带欲，就是世间法。杜世杰说：“红学上所创造之人物，除一身况阴阳二人外，必须代表一种世间法。”还有书中的人物扮演历史人物，主要取决于名称的使用。如黛玉称绛珠草可演朱明草民，称潇湘妃子可演夷人妃子。至于这样推断的根据何在?杜世杰会说是基于他所理解的《红楼梦》的结构；而结构是由他的推断演化出来的，如此循环往复，形成了他的索隐理论和索隐方法的循环圈。
　　特别是杜世杰提出《红楼梦》中名称的运用，可以不受时间和空间的限制，更暴露了他的索隐理论和索隐方法的非科学性。他在“总论”第二篇第六章“名词之运用”一节中写道：