诸葛亮卒，刘禅素服发哀三日，李邈上疏曰：“亮身杖强兵，狼顾虎视。今其殒没，盖宗族得全，西戎静息，大小为庆。”（《三国志·杨戏传》注引《华阳国志》）刘禅怒，下狱诛之。有人欲为诸葛亮在成都立庙，刘禅以其近宗庙为由而不从。向充等上表曰：“亮德范遐迩，王室之不坏，实斯人是赖。宜近其墓，立庙沔阳，以崇正礼。”（《三国志·诸葛亮传》注引《襄阳记》）刘禅乃从之。
　　晋代魏，司马炎向故蜀臣樊建咨问诸葛亮治国之策。樊建曰：“闻恶必改，而不矜过，赏罚之信，足感神明。”司马炎曰：“善哉！使我得此人以自辅，岂有今日之劳乎！”（《三国志·樊建传》注引《汉晋春秋》）文立向司马炎上言：“故蜀之名臣子孙流徙中国者，宜量才续用，以慰巴蜀之心，倾吴人之望。”司马炎从之，诏曰：“诸葛亮在蜀，尽其心力，其子瞻临难而死义，天下之善一也，其孙京宜随才署吏。”（《资治通鉴·晋武帝泰始五年》及《三国志·诸葛瞻传》注引《晋泰始起居注》、山涛《启事》）诸葛京出为郿县令，后至江州刺史。司马炎令陈寿编撰《诸葛亮集》。
　　当诸葛亮屡出陇右时，曹睿恨其是“外慕立孤之名，而内贪专擅之实”（《三国志·明帝纪》注引《魏略》）。当诸葛亮长眠定军山后，司马炎却乖道欲“得此人以自辅”。司马骏谓诸葛亮托身非所，劳困蜀民，力小谋大，不能度德量力。这与司马懿的一些看法相似。司马炎也不会不知其所短，而少言其短，多扬其长，自然有之寓意。
　　自司马懿诛曹爽，经司马师废曹芳、司马昭弑曹髦，至司马炎迫曹奂禅位，在司马氏兴起的这段时期里，王凌、毌丘俭、诸葛诞、钟会等这些忠魏反晋及背晋自图者迭连起兵，他们虽然相继失败，但是对司马氏政权皆构成威胁。司马炎知道魏晋之权虽来之实力，但皆落有不忠之柄，且影响在蔓延。他欲止之，要尽量避免螳螂捕蝉，黄雀在后。尊崇有能力的敌手无可非议，然司马炎尊崇诸葛亮，用意很可能是希望群下能以其忠诚为榜样，为大晋鞠躬尽瘁，死而后已，不要效仿那些叛乱者。后连晋明帝都为其祖取天下的行为感到羞愧，后世帝王也只能歌颂诸葛亮，不会赞美司马氏。
　　在私天下的社会里，用人与防人是最棘手的问题。刘备能使能臣辅暗子，处理的还算好。诸葛亮全力北伐，若他完成一统，是否仍会甘愿为臣？他死于征途，不管功业如何，却使忠名得以流芳。诸葛亮曾论让夺曰：“范蠡以去贵为高，虞卿以舍相为功；太伯以三让为仁，燕哙以辞国为祸；尧舜以禅位为圣，孝哀以授董为愚；武王以取殷为义，王莽以夺汉为篡；桓公以管仲为霸，秦王以赵高丧国。此皆趣同而事异也。明者以兴，暗者以辱乱也。”（张澍《诸葛忠武侯文集》卷二《论让夺》）说明他对功名的认识相当清楚。刘备妙以汉胄去嫌，诸葛亮遗恨而全节；曹操、司马懿最终无法纸包住火，露出原形，结果毁誉参半。英雄风云一生，但后人难以依实论功过，多要依自身利益和所好加以褒贬。