海和尚死得如此离奇，自然轰动全城。杨雄再傻也心知肚明这是石秀干的，也猜到石秀说的基本是事实。于是杨雄向石秀道歉，并心头火起，说老子去宰了那个骚货。这时，石秀劝阻说，你听了你老婆一面之词就把我赶走，现在听了我的一面之词又要去杀你老婆，你也算是司法系统里工作的人，怎么能这么草率，你有没有证据？万一我是在胡说，你不又杀错人了吗？于是建议把巧云弄到翠屏山去问问清楚，杨雄采纳。事情真相大白后，在石秀的唆使下，杨雄将巧云和帮她安排通奸的使女迎儿给杀了。从这个故事来看，石秀的厚黑段数不低，是个有黑帮老大潜质的人物。
　　很多朋友为此诟病石秀滥杀和阴险。无斋主人无意为石秀辩护，这可以算是他的一个污点。不过想指出一点，虽然石秀的确是狠了一点，但一直身处弱势、备受强势集团欺凌的石秀还有其他好办法洗脱自己的冤屈吗？丢失工作，背负“调戏大嫂”的不实罪名，难道石秀就应该忍辱负重，自己默默忍受委屈吗？考虑到和尚不受清规犯淫戒，按照宋朝的法律本来就应该杀头。石秀真要是阴险完全可以安排一些人证、一起捉奸，这样通奸的潘、海两人还是一死，石秀亦可洗脱，自己还不用犯法。但如此一来，杨雄的绿帽子就全城尽知了。这种事，以石秀的为人绝对不会做，他宁可自己来承担杀人的罪责。无斋主人以为这正是他为人磊落的地方。后来杨雄杀迎儿和巧云也是这个原因，这顶绿帽子对杨雄来说是最大的羞辱，唯有把当事人全杀了才能保全名声。这种做法按现代观点，的确是滥杀和残忍，但从当时身处底层的石秀的角度来看，却是顺理成章的。对他来说，杨雄的名誉和石、杨两人的兄弟之情远高过奸夫淫妇的性命。他所作的不过是替天行道、代天执法而已。还是那句话，该出手时就出手。
　　既然杀了人，杨雄、石秀当然在蓟州市是呆不下去了。更何况要是事发，问起来巧云的奸情必然会公开化，这显然会使杨雄受羞辱，所以必须要找一条退路。于是前面的伏线就起作用了，石秀说没问题，我们可以上梁山，戴宗曾经拍胸口保证他可以做介绍人。这时有个细节十分精彩：
　　“杨雄道：‘既有这条门路，我去收拾了些盘缠便走。’石秀道：‘哥哥，你也这般搭缠。倘或入城事发拿住，如何脱身？放着包裹里现有若干钗钏首饰，兄弟又有些银两，再有三五个人，也够用了，何须又去取讨。惹起是非来，如何解救？这事少时便发，不可迟滞，我们只好望山后走。’”
　　这个对比，杨雄和石秀的差距太明显了，杨雄太过婆婆妈妈，这时候还要回家去收拾盘缠。而石秀的干练、思路清晰跃然纸上。这样的人才是干大事情的人物。
　　四、投奔梁山
　　正当杨雄、石秀商量上梁山时，杨监狱长曾关照过的小偷时迁正好在一旁目击了全部过程。于是时迁就跳出来说，你们要投梁山就带上我。凭良心说，当时杨、石两人也只能带时迁走，否则就不得不杀时迁灭口。不然杨雄的绿帽子就会被时迁传出去，而且一旦时迁报官，他们也不一定走得了。要杀时迁，论武功杨雄、石秀是没有问题的，但时迁轻功过人，要逃跑估计也不是什么难事。以石秀的精细，这些算计在脑海里一闪而过，于是石秀说没问题，梁山也不多你一个。但没想到这个时迁却惹出来天大的麻烦。
　　石秀三人投奔梁山时，途径祝家庄，这个时迁贼心不改，偷了人家店里报晓的公鸡吃了，宋代没有时钟，这个报晓的公鸡就十分珍贵。这就好比把人家珍藏的16世纪的名酒给喝了一样，惹出了大麻烦。结果时迁被抓，石秀、杨雄逃上梁山。
　　石秀、杨雄以这样的身份逃上梁山是极其狼狈的，这个偷鸡贼共犯的经历和在祝家庄假报梁山名号的劣迹，差点让晁盖把他们给杀了。幸而宋江因为自己的利益，需要对外行动来树威而出面救了石秀、杨雄两人，当然也有市恩的意思，因为晁盖要杀他们，宋江救了他们，日后晁、宋之间争斗时站在哪一边是不言而喻的。正是因为这个不光彩的纪录，杨雄、石秀两人在梁山初期的地位不高，经常是被派出去打探消息。这些差事日后都是些小角色去做的。宋江派给石秀的第一个任务就是去探祝家庄的路。其实无斋主人不明白为啥派石秀去，按理说石秀刚在祝家庄惹了事，烧过店、杀过人，这样的熟面孔再当特务去探路岂非儿戏？却不料宋江的这一安排，却让石秀脱颖而出，石秀不仅成功地从钟离老人那里探明了盘陀路的机关，而且还帮助陷入迷宫的宋江脱围，显示了超强的情报工作能力。不久石秀又假败、甘愿被卧底的孙立俘虏到祝家庄当内应，这也是要冒很大风险的，因为说不准石秀就可能被祝家庄杀了。石秀为打破祝家庄立下了大功，从而也在梁山站稳了脚跟。
　　其后梁山的每次重大行动石秀也几乎无役不与。甚至连晁盖的曾头市一战都没有拉下。要知道晁盖原先是要杀石秀和杨雄的，但到了自己最关键的时刻，还是带上了石秀和杨雄。一方面是因为晁盖自己的班底实在少得可怜，另一方面也说明了石秀的努力得到了回报。石秀知道自己出身低微，武功虽不错，但在梁山也算不得顶级高手，自己要出头必须要比别人多付出几倍的努力。但石秀最最出彩的一页，却是在大名府。